Botoks uygulaması genellikle tolerans edilebilir bir ağrıyla ilişkilendirilir. İğne kullanılarak yapılan enjeksiyonlar sırasında hafif bir rahatsızlık hissi olabilir, ancak çoğu kişi tarafından dayanılabilir olarak değerlendirilir. Ayrıca, uygulama öncesinde genellikle lokal anestezik krem kullanılır ve bu da ağrıyı azaltmaya yardımcı olur.
